圖牧吉自然保護(hù)區(qū)位于旗境南部的圖牧吉鎮(zhèn)內(nèi)，距旗政府所在地音德爾50公里。

　　保護(hù)區(qū)總面積948.3平方公里，其中：有水域面積53.6平方公里，沼澤濕地面積220.6平方公里，草原面積368.9平方公里，保護(hù)區(qū)內(nèi)有7個(gè)村28個(gè)自然屯，人口1萬余人。保護(hù)區(qū)有動(dòng)物71科309種，其中鳥類228種，屬國(guó)家一級(jí)保護(hù)的鳥類9種，二級(jí)保護(hù)鳥類36種，國(guó)家一級(jí)保護(hù)的鳥類大鴇是該保護(hù)區(qū)最具特色之處，是我國(guó)僅有的少數(shù)大鴇繁殖區(qū)之一，被譽(yù)為大鴇的故鄉(xiāng)。保護(hù)區(qū)內(nèi)有哺乳動(dòng)物5目10科26種，其中國(guó)家二級(jí)保護(hù)獸類1種。保護(hù)區(qū)內(nèi)植物分屬79科275屬476種，資源豐富，因此，該保護(hù)區(qū)是溫帶草原生態(tài)系統(tǒng)、濕地生態(tài)系統(tǒng)生物多樣性研究與保護(hù)的典型區(qū)域之一，是大鴇、鶴類、鸛類等鳥類資源保護(hù)研究的重要基地。

　　保護(hù)區(qū)劃分為三個(gè)功能區(qū)：第一為核心區(qū)，具有典型的草原生態(tài)系統(tǒng)和沼澤生態(tài)系統(tǒng)，特別是國(guó)家一二級(jí)保護(hù)物種的棲息、繁殖地。第二為緩沖區(qū)，位于核心區(qū)外圍，對(duì)核心區(qū)起緩沖和屏障作用。第三為實(shí)驗(yàn)區(qū)，位于緩沖區(qū)外圍，是保護(hù)區(qū)管理局、野生動(dòng)物救護(hù)、馴養(yǎng)中心、宣傳中心所在地及多種經(jīng)營(yíng)生產(chǎn)實(shí)驗(yàn)基地。
　
　　1996年始建為旗縣級(jí)自然保護(hù)區(qū)，1998年2月晉升為自治區(qū)級(jí)自然保護(hù)區(qū)，是第一個(gè)以保護(hù)大鴇的繁殖地為主的自然保護(hù)區(qū)。2002年7月2日國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)為國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)。

　　保護(hù)區(qū)東南部豐富的水面和大片的沼澤濕地，造就了大面積的淺灘草原區(qū)和廣闊的深草區(qū)，幽幽千畝香蒲搖曳，茫茫萬頃蘆葦蕩漾，為眾多鳥類提供了充足便利的覓食條件，也為它們提供了不受驚擾的棲息繁衍的場(chǎng)所。它們一對(duì)對(duì)，一群群，時(shí)而飄然水面，時(shí)而云集藍(lán)天，構(gòu)成了一幅動(dòng)靜結(jié)合壯美而幽雅的藍(lán)天碧水百鳥圖。每年春秋季節(jié)有成千上萬只水鳥過境停歇。保護(hù)區(qū)內(nèi)有鳥類228種，其中有國(guó)家一級(jí)保護(hù)鳥類大鴇、丹頂鶴、金雕等9種，國(guó)家二級(jí)保護(hù)鳥類36種。僅鶴類就有6種分布在保護(hù)區(qū)內(nèi)，是我國(guó)鶴類分布最為集中的區(qū)域之一。